农业公司免税的性质主要包括以下几点：从事特定农业项目 农业公司若从事国家鼓励的农业项目，如种植特色农产品、生态农业、有机农业等，可能享受免税政策。国家针对这些特定项目免税，是为了鼓励农业发展，促进农业产业升级。小微企业及初创企业 农业领域的小微企业和初创企业往往能享受一定的免税期。
种植特定农作物：某些种植特定农作物的公司，如种植绿色食品原料的企业，可能根据国家政策享受免税待遇。这通常是为了鼓励绿色农业和有机农业的发展。 生态农业和可持续发展项目：随着环保意识的增强，生态农业和可持续发展项目得到了越来越多的关注。从事此类项目的农业公司也可能享受到免税优惠。
另外，农业生产者销售的自产农产品免征增值税。农业公司一般是免税的，但无论是免税还是应交税，都应该按月报税增值税纳税申报表和有关财务资料，并按季报送企业所得税纳税申报表。
法律分析：农业生产者销售的自产农产品，免增值税。从事农、林、牧、渔业项目的所得，可以免征、减征企业所得税。对从事农业机耕、排灌、病虫害防治、植保、农牧保险以及相关技术培训业务，家禽、牲畜、水生动物的配种和疾病防治工作所取得的收入，免增值税。
1、一般来说，农产品初加工可以按照增值税一般纳税人的方式缴纳增值税，也可以按照小规模纳税人的方式缴纳增值税。具体缴纳方式需要根据企业的具体情况和税务政策来确定。对于增值税一般纳税人来说，农产品初加工企业需要计算销项税额和进项税额，然后按照差额缴纳增值税。
2、第十七条 纳税人销售额未达到国务院财政、税务主管部门规定的增值税起征点的，免征增值税；达到起征点的，依照本条例规定全额计算缴纳增值税。
3、即可办理申请购买发票事宜，税务局会核定你公司的交税税种的。拿到工商执照、法人代码证和银行开户许可证后，应在一月内向税务局申请税务事宜。另办理税务登记时要填写相关表格，还要有法人和财务负责人的身份证复印件等等。这是北京地区的手续。各地情况可能有所区别，具体你可到当地税务机关咨询。
办理农副产品加工厂需要完成一系列手续，包括食品生产许可证、工业产品生产许可证、消防许可、环保批文、食品流通许可证等。这些手续的办理将根据加工的农产品的种类、加工流程和加工程度的不同而有所区别。
需要生产许可证和生产资格证书。农产品初级加工一般需要获得生产许可证和生产资格证书。生产许可证是由相关政府部门颁发的，用于监管和控制农产品初级加工环节的合法性和质量安全。它确保生产者符合相关的法律法规和卫生标准，并具备必要的生产设施和设备。
农产品初级加工通常需要办理生产许可证和生产资格证书。具体申请流程可以咨询当地农业部门，之后还需到工商部门办理营业执照。 农产品初加工涉及对农产品进行一次性加工，不改变其内在成分，包括去除杂质、分类、干燥、去皮、软化或大批量包装等活动，以便供初级市场销售。
办农副产品加工厂需要办理食品生产许可证、工业产品生产许可证、消防许可、环保批文、食品流通许可证等手续。农副产品加工厂根据加工的农产品的种类，加工的流程，加工的不同程度，选择办理。
一种是加工食品（需要办理），例如金华火腿，就是加工食品。加工特产食品，需要办理生产许可证，获证之后才能生产。不加工特产食品但销售特产食品的，需要办理食品经营许可证（就是以前的食品流通许可证）建议去当地工商部门咨询一下，因各地政策不同，没有特定的标准。
